Porcs - ferme / Swine - farm

Comparaison des tests rtPCR SRRP de Biovet et Tetracore

Depuis l’automne 2020, tous les échantillons qui nous sont soumis pour des tests rtPCR SRRP sont testés en

Depuis l’automne 2020, tous les échantillons qui nous sont soumis pour des tests rtPCR SRRP sont testés en parallèle avec la trousse Tetracore (EZ-PRRSV MPX) et le test « in house » Biovet. Nous avons récemment compilé les résultats des tests réalisés fin 2020 sur 1514 échantillons divers (sérums, fluides oraux, « processing fluids », poumons). Les résultats obtenus début 2021 n’ont pas été analysés faute de temps mais ils semblent bien confirmer ceux de 2020.

Les 1514 échantillons provenaient de 824 dossiers et d’environ 385 élevages. Nous ne pouvons malheureusement être plus précis quant au nombre d’élevages car un même élevage peut être désigné sur les requêtes par des noms différents. Deux cent cinquante-quatre (254) échantillons se sont révélés positifs au moyen de l’un et/ou de l’autre test (16,8% d’échantillons positifs).

Deux cent trente-six (236) échantillons se sont révélés positifs avec les deux tests et les 18 résultats discordants concernaient des échantillons avec des charges virales très faibles (Ct > 34). En utilisant la trousse Tetracore ou le test de Biovet comme test de référence (gold standard), les deux tests démontrent une sensibilité et spécificité relatives équivalentes (respectivement 95,16% et 99,53%) et un accord presque parfait (kappa :0,957).

Tetracore
positif
Tetracore
négatif
Biovet positif 236 6 242
Biovet négatif 12 1260 1272
248 1266
Sensibilité 95,16% (CI : 91,73 – 97,21%)
Spécificité 99,53% (CI : 98,97% – 99,78%)
Coefficient kappa 0,957 (accord presque parfait)

Dans plus de la moitié des dossiers pour lesquels des échantillons donnaient des résultats discordants entre les deux tests, au moins un autre échantillon était positif dans les deux tests. En fait, aucune souche ne semble avoir été manquée par l’un ou par l’autre test. Par ailleurs, pour l’ensemble des résultats concordants, les Ct obtenus avec le test de Biovet étaient en moyenne légèrement inférieurs à ceux obtenus avec le test de Tetracore (figure 1).


En conclusion, considérant les résultats obtenus sur plus de 1500 échantillons, on peut dire que les deux tests performent de manière très semblable. Afin de réduire les risques de manquer certaines souches, nous avons toutefois décidé de continuer à tester systématiquement tous les échantillons qui nous sont soumis au moyen des deux tests. Ceci sera fait SANS aucun frais supplémentaire.

Pour plus d’information, n’hésitez pas à communiquer avec nous.

Christian Savard, Directeur R&D biologie moléculaire

Olivier Ariel, Responsable laboratoire biologie moléculaire

André Broes, Responsable support technique